政府部門整併公協會與財團法人呼聲不斷，特別是工研院與資策會更是被點名合併的兩大研究法人。
新政府有意整合工研院、資策會兩大法人，自5月19日前資策會執行長請辭後，新任經濟部長李世光即指派工研院院長劉仲明，同步兼任執行長。20日劉仲明也已到資策會聽取業務簡報，此舉也被外界解讀為兩大法人軟硬整合的暖身。