台灣因非法捕魚事件頻傳，於10月1日被歐盟正式列入打擊IUU不合作第三國黃牌名單，限期6個月內改善，若台灣被列入黑名單，將面臨每年近5億2000萬元的損失。民間團體與海洋學者站出來呼籲政府該正視此問題，應建立公開透明的漁業資訊申報系統，以確保漁民、消費者的權益。

為了打擊「非法、未報告、不受規範」漁業（Illegal, Unreported, Unregulated, IUU），歐盟自2010年開始，將未有效打擊IUU的國家列為不合作國家，一開始先向該國發出正式警告（稱為黃牌），如指定時間內未能改善漁業管理以達國際標準，即列入黑名單（紅牌），面臨一系列制裁，包括禁止所有水產品出口至歐盟。台灣一旦被列入黑名單，將面臨每年上看5億2000萬元的損失。

國立海洋大學教授、立法委員邱文彥表示，政府應當正視該問題，台灣漁業被國際抨擊的，在於登載資訊不透明，不論是魚獲量、捕獲魚種，都沒有明確透明的機制，以至於除了有船舶管理系統的大船以外，大部份小漁船的作業無法有效掌握，進而造成執法、監督的困難，也才讓漁民有漏洞可鑽。

漁業申報資訊的不確實，將會造成無法正確追蹤魚群數量、無法管制非法漁獲等後果，消費者也無法正確得知自己魚獲的來源，長期而言對保育的推動、資源的管理、消費者權益都是不利的影響。

由台灣海龍王愛地球協會、台灣媽祖魚保育聯盟、台灣環境資訊協會等五個團體發起的『找出「來去無蹤」的魚─台灣公民對沿近海漁業改革建議』也指出，雖然2016年7月1日漁業署的「卸魚聲明書申報管理規定」將要上路，但除了由漁會向漁業署申報的單一管道外，建議也該由漁民透過科技設備主動申報，藉由雲端系統彙整明確的數據。

民間團體與學者共同呼籲，希望政府正視台灣漁業法規與執行面的長期問題，建立可行的、公開透明的申報系統，並確實把關，推動海洋產業永續發展，以保障漁民與消費者權益。